Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms