Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXB3P14651 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXB3P14651 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXB3P14651 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXB3P14651 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXB3P14651 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXB3P14651 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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