Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm31135-201ENSMUST00000208460 1782 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 D930048N14Rik-201ENSMUST00000064493 3426 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Nnt-206ENSMUST00000223268 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm7933-201ENSMUST00000191215 2255 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkcshO08795 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms