Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM30AQ9NV96 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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