Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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