Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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