Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDR2Q01850 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms