Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms