Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms