Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGFP49763 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGFP49763 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGFP49763 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms