Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA4P43681 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms