Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD13P35453 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms