Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR1P32246 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR1P32246 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCR1P32246 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms