Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms