Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC140479.1-201ENST00000440423 337 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC093714.1-201ENST00000470532 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC013451.2-201ENST00000556652 667 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ANP32AP1-201ENST00000559548 737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 LINC01511-202ENST00000504989 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ERLIN2-203ENST00000397228 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC005702.1-202ENST00000586209 1603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ZNF839P1-201ENST00000403487 861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 RN7SKP65-201ENST00000410278 313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AL356488.1-201ENST00000429752 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 DAPK1-IT1-201ENST00000431813 702 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 LINC00578-204ENST00000446548 519 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATXN8OSP0DMR3 TRPC5OS-202ENST00000612026 1043 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms