Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPLO60437 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPLO60437 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPLO60437 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPLO60437 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPLO60437 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPLO60437 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPLO60437 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPLO60437 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPLO60437 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms