Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms