Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms