Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBBP8Q99708 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP8Q99708 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms