Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SSX1Q16384 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SSX1Q16384 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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