Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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