Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms