Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms