Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYBBP04839 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms