Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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