Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTKNQ9BST9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms