Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Vmn1r200Q8R281 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vmn1r200Q8R281 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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