Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms