Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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