Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC6Q16204 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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