Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms