Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms