Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms