Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms