Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD1Q15327 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms