Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NCOA4Q13772 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms