Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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