Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms