Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P62684 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms