Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms