Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM33Q9UPN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM33Q9UPN9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms