Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms