Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EHD3Q9NZN3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD3Q9NZN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms