Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECHDC1Q9NTX5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
ECHDC1Q9NTX5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms