Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
DUOX2Q9NRD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
DUOX2Q9NRD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms