Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRTNQ9H040 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms