Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc97Q9DBT3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc97Q9DBT3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms