Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn9Q9D805 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn9Q9D805 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms