Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup37Q9CWU9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup37Q9CWU9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup37Q9CWU9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms