Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM7Q9C029 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms